1、預繳的前提
建筑業預繳的前提是跨地區經營。國家稅務總局公告2016年第17號關于發布《納稅人跨縣（市、區）提供建筑服務增值稅征收管理暫行辦法》的公告第三條規定，納稅人跨縣（市、區）提供建筑服務，應按照財稅〔2016〕36號文件規定的納稅義務發生時間和計稅方法，向建筑服務發生地主管國稅機關預繳稅款，向機構所在地主管國稅機關申報納稅。
房地產業預繳的前提是收到預售房款。國家稅務總局公告2016年第18號關于發布《房地產開發企業銷售自行開發的房地產項目增值稅征收管理暫行辦法》的公告規定，一般納稅人或小規模納稅人采取預收款方式銷售自行開發的房地產項目，應在收到預收款時按照3%的預征率預繳增值稅。一般納稅人應在取得預收款的次月納稅申報期向主管國稅機關預繳稅款。
由于房地產企業經營的特殊性，一般會在項目當地設立房地產公司，項目結束后即辦理注銷手續，一般情況下不存在跨地區經營的情況。
2、預繳的預征率
建筑業：36號文和17號公告均有規定，選擇一般計稅方法計稅的，納稅人應以取得的全部價款和價外費用扣除支付的分包款后的余額，按照2％的預征率在建筑服務發生地預繳稅款后，向機構所在地主管稅務機關進行納稅申報；選擇適用簡易計稅方法計稅的，應以取得的全部價款和價外費用扣除支付的分包款后的余額為銷售額，按照3%的征收率計算應納稅額。
房地產業：18號公告規定，房地產企業，無論是一般計稅方法還是簡易計稅方法，無論是一般納稅人還是小規模納稅人，其預征率均為3%。
3、預繳的基數
建筑業預繳的基數是納稅人從取得的全部價款和價外費用中扣除支付的分包款，但應當取得符合法律、行政法規和國家稅務總局規定的合法有效憑證，否則不得扣除。納稅人應按照工程項目分別計算應預繳稅款，分別預繳。
上述合法有效憑證是指：（一）從分包方取得的2016年4月30日前開具的建筑業營業稅發票。上述建筑業營業稅發票在2016年6月30日前可作為預繳稅款的扣除憑證。（二）從分包方取得的2016年5月1日后開具的，備注欄注明建筑服務發生地所在縣（市、區）、項目名稱的增值稅發票。
房地產業預繳的基數是收到的預收款。
4、預繳提供的資料不同
建筑業：17號公告規定，納稅人跨縣（市、區）提供建筑服務，在向建筑服務發生地主管國稅機關預繳稅款時，需提交以下資料：
（一）《增值稅預繳稅款表》；
（二）與發包方簽訂的建筑合同原件及復印件；
（三）與分包方簽訂的分包合同原件及復印件；
（四）從分包方取得的發票原件及復印件。
房地產業：房地產開發企業銷售自行開發的房地產項目，按照本辦法規定預繳稅款時，應填報《增值稅預繳稅款表》。
5、預收款是否構成納稅義務發生時間
建筑業：建筑服務收到預收款時不產生納稅義務，只是預繳稅款。
房地產業：收到預收款并不產生納稅義務，只是預繳稅款。
6、預繳稅款的抵繳
建筑業：納稅人跨縣（市、區）提供建筑服務，向建筑服務發生地主管國稅機關預繳的增值稅稅款，可以在當期增值稅應納稅額中抵減，抵減不完的，結轉下期繼續抵減。納稅人以預繳稅款抵減應納稅額，應以完稅憑證作為合法有效憑證。
房地產業：18號公告規定，納稅人銷售自行開發的房地產項目應按照《營業稅改征增值稅試點實施辦法》（財稅〔2016〕36號文件印發）第四十五條規定的納稅義務發生時間，以當期銷售額和11%或5%的稅率計算當期應納稅額，抵減已預繳稅款后，向主管國稅機關申報納稅。未抵減完的預繳稅款可以結轉下期繼續抵減。房地產開發企業以預繳稅款抵減應納稅額，應以完稅憑證作為合法有效憑證。
7、預繳稅款的開票問題
建筑業：外地預繳如何開票?一般情況下，由于受納稅人識別號和防偽稅控系統發行的屬地限制，目前是在機構所在地自行領購并開具發票。
房地產業：在（V2.0.11）版本開票系統中選擇發票代碼為602的“銷售自行開發的房地產項目預收款”進行開具。需要注意的是：1、房地產預收款不得開具增值稅專用發票！2、發票稅率欄應填寫“不征稅”，原因就是房地產開發企業銷售自行開發的房地產的預售款并不產生納稅義務，是一種特殊預繳政策。
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